L’Abbé Deleuze, curé de la Paroisse Sainte Geneviève des Grandes Carrières est à l’origine de cette association, et ceci à la fin du XIX siècle.

L’Abbé Deleuze était fortement imprégné de la nécessité de mettre en œuvre les grandes orientations de la doctrine sociale de l’église ( édicté dans l’enseignement de l’Encyclique « Rérum novarum » rédigée par le Pape Léon XIII ).

Dans le cadre de son action dans un quartier ouvrier du nord de Paris, l’Abbé Deleuze s’est vite montré sensible au sort des enfants et des jeunes qui étaient soit livrés à eux-mêmes et désoeuvrés, soit victimes d’abandon ou de comportement maltraitant de la part des adultes.

C’est ainsi qu’il a fondé vers 1897 un orphelinat. Celui-ci était géré par des religieuses « les Sœurs franciscaines de Seillon », devenues par la suite « les Sœurs franciscaines de la Butte Montmartre ».

En 1919, l’église crée officiellement une congrégation religieuse qui va gérer la maison d’enfants. Il s’agit de la Congrégation du Sacrée Cœur qui était alors soutenue par de nombreux donateurs du quartier. A l’époque, les œuvres catholiques étaient exclues du bénéfice des subventions gouvernementales.

Avec les lois de 1901 et de 1904 visant à limiter les activités des œuvres catholiques et à en gagner leur contrôle par l’Etat, la congrégation religieuse de l’Orphelinat Notre Dame du Sacré Cœur est amenée à changer de structure juridique afin d’échapper au risque d’être étouffée par les pouvoirs publics.

L’acte de naissance de l’Association Notre Dame du Sacrée Cœur est signé le 20 décembre 1952. La structure juridique est désormais résolument laïque. L’association (de type loi 1901) utilisera encore néanmoins les services de la congrégation pour réaliser la mission de sont établissement.

Le début des années 1970 marque la fin d’un certain type de fonctionnement des maisons tenues par les congrégations en France. La « Maison d’Enfants Clair Logis » doit alors se conformer aux nouvelles exigences du secteur de la prise en charge de l’enfance. Il lui faut alors obtenir une habilitation pour continuer à recevoir des mineurs bénéficiant de l’assistance éducative.

L’obtention de cette habilitation est la condition sine qua non pour être reconnue par les pouvoirs publics et pour avoir accès aux subventions sous formes de prix de journée.

L’habilitation est obtenue par la Maison d’Enfants le 1er janvier 1973.

Un personnel laïc remplacera les religieuses au fur et à mesure de leurs départs.